遺伝子系図

遺伝子系図（いでんしけいず、英: genetic genealogy）とは、遺伝子上の情報を基にした系図である。

個体間の遺伝的関係やその度合いを決定する目的で用いられる。

概要

分子生物学やコンピュータ技術の進展により、ある個体からサンプルされたオーソロガスな遺伝子について、ヌクレオチド単位で個体間比較、種間比較が可能となった。このことは遺伝子の進化の歴史や系統関係について実験や統計を用いて定量的に議論できることを意味する。

しかしながら、実際には生物集団内における遺伝子系図を決定することは容易ではない。これは個体が移動すること（遺伝子流動）や核マーカーにおける遺伝的組み換えの効果、自然選択の効果、また、個体群動態の変化などが遺伝子系図のトポロジーや枝長に影響を与えるためである。これらの効果を区別することは容易ではないが、主に合祖理論を基盤とした研究によってこの問題は議論されている。

使用例

• Y染色体ハプログループ
• ミトコンドリアDNAハプログループ

参考文献

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関連項目

関連文献

出版年順

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• Takahata N (1989) "Gene genealogy in three related populations: consistency probability between gene and population trees." Genetics, 122, 957–966.
• Hudson RR (1990) "Gene genealogies and the coalescent process." Oxford Surveys in Evolutionary Biology 7: 1–44.
• Kingman, J.F.C. (2000) "Origins of the coalescent 1974–1982." Genetics 156:1461–1463.
• Rosenberg and Nordborg (2002) "Genealogical trees, coalescent theory and the analysis of genetic polymorphisms." Nature Reviews Genetics 3: 380–390.
• 斉藤成也「遺伝子からみた東ユーラシア人」『地學雜誌』第111巻第6号、東京地学協会、2002年12月、832-839頁、doi:10.5026/jgeography.111.6_832、ISSN 0022135X、NAID 110000380014。 
• 鈴木増雄、荒船次郎、和達三樹（編）『物理学大事典』朝倉書店、2005年。「遺伝子系図学」766、「遺伝的浮動」765。
• 日本バイオインフォマティクス学会（編）『バイオインフォマティクス事典』共立出版、2006年。「遺伝子系図」585、「遺伝統計学多型マーカー」587。
• 森林総合研究所（編）『森林大百科事典』朝倉書店、2009年。「遺伝子系図」259、「遺伝子系統樹」265、「遺伝子多様度」260、「遺伝子地図」251。
• 津村義彦、陶山佳久（編）『森の分子生態学』第2巻、文一総合出版〈種生物学研究 ; 特別号〉、2012年。「遺伝子系図学 gene genealogy」53。
• 日本進化学会（編）『進化学事典』共立出版、2012年。「遺伝子系図」506-509, 511-514, 673、「遺伝子系図学」630、「遺伝子系図」50916.5。
• 小酒井亮太「地理的構造を持つ遺伝子系図モデルの研究」名古屋市立大学 博士論文 (生体情報), 甲第1546号、2016年、NAID 500000975142。 
• 「遺伝子系図を使った犯罪捜査への期待と懸念」『Natureダイジェスト』第17巻第12号、東京 : ネイチャー・ジャパン、2020年12月、16–21。ISSN 2189-7778。