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ヘリックスターンヘリックス
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ヘリックスターンヘリックス(Helix-turn-helix、HTH)とは、タンパク質の主要な構造モチーフの一つで、DNAに結合する性質を持つ。2つのαヘリックスが短いペプチド鎖で繋がった構造を持ち、遺伝子発現を制御するタンパク質に特に多く見られる。
このモチーフは、Cro、CAP、λリプレッサーに存在する20-25アミノ酸残基の共通配列として発見された。特にDNAを認識し結合する部位は2つのヘリックスのうち1つのN末端ともう1つのC末端にある。またCroリプレッサーを含む多くの場合は2つ目のヘリックスはDNAの認識に関わっている。DNAへの結合は水素結合と塩基部分のファンデルワールス力によっている。もう1つのヘリックスはDNAとタンパク質の結合を安定化させるが、その認識にはあまり関わらない。
関連項目
参考文献
- Brennan R, Matthews B (1989). “The helix-turn-helix DNA binding motif”. J. Biol. Chem. 264 (4): 1903-6. PMID 2644244. http://www.jbc.org/cgi/reprint/264/4/1903.
- Matthews B, Ohlendorf D, Anderson W, Takeda Y (1982). “Structure of the DNA-binding region of lac repressor inferred from its homology with cro repressor”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 79 (5): 1428-32. PMID 6951187. http://www.pubmedcentral.nih.gov/picrender.fcgi?artid=345986&action=stream&blobtype=pdf.