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1000人ゲノムプロジェクトは2008年1月に始まった国際研究協力の一つで、ヒトの遺伝的多様性に関する、現時点で最も詳細なカタログを確立するためのゲノムプロジェクトである。
これまで以上に高速かつ廉価な新開発技術(次世代シーケンシング)を用いて、科学者たちは3年以内に、異なる民族グループから少なくとも1000人分の匿名ゲノムの配列決定を行うことを目指している。
プロジェクトは学際的な研究チームで構成されており、世界中の研究機関が参加している。それぞれのチームが大量の配列データセットと詳細ヒトゲノムマップ作成に寄与している。それらのデータは、公共のデータベースを介して、一般市民が自由にアクセスできるようになる。
2010年、試験段階が終了し、その詳細はNatureに掲載された。 2012年10月、1092人のゲノムシーケンシングがNatureで発表された。 2015年には、プロジェクトの結果と将来への展望に関する2つの論文がNature誌に掲載された。
全てのヒト遺伝的変異について概要を提供することにより、医学のみならず、生物学分野においても有用な知見を得られると考えられる。特に、遺伝学、薬理学、生化学、バイオインフォマティクス、各分野の発展に寄与するだろう。